Willy est une orque mâle, capturée puis vendue à un centre aquatique pour y être dressée et exploitée. Jesse, préadolescent abandonné par sa mère, rebelle à l'autorité et fugueur, est arrêté pour vandalisme au cours d'une fugue et placé dans une famille d'accueil qui désire l'adopter. Il doit nettoyer ses graffitis au centre aquatique et y fait la rencontre de Willy qui devient peu à peu son meilleur ami. Mais puisque l'orque ne coopère pas au spectacle qu'on attend de lui, elle manque de se faire tuer sur ordre du peu scrupuleux propriétaire des lieux. Jesse et ses nouveaux amis décident de l'aider à regagner la mer et la liberté....

Les millions de fans de Keiko à travers le monde apprennent enfin la vérité sur ce qui s'est réellement passé lorsque la star de Sauvez Willy est devenue la première et la seule orque captive à être relâchée dans la nature. Le candidat le plus improbable à la libération en raison de ses longues années de captivité a en fait prospéré pendant plus de 5 ans dans ses eaux natales, gagnant plus de 3000 livres pendant sa rééducation, la mélangeant avec des orques sauvages, nageant à travers l'Atlantique Nord et passant finalement comme une orque d'âge moyen en tant que seule orque captive à avoir été réhabilitée avec succès et relâchée dans la nature....

...