Ce programme de neuf courts métrages faisant appel à diverses techniques d'animation (animation classique, manga, images de synthèse...), raconte plusieurs histoires au sein du monde de la Matrice autour de la guerre hommes/machines. 1 - Le Dernier Vol de l'Osiris 2 - La Seconde Renaissance, partie 1 3 - La Seconde Renaissance, partie 2 4 - L'Histoire de Kid 5 - Programme 6 - Record du monde 7 - Au-delà 8 - Une histoire de détective 9 - Matricule...

Un petit groupe d'humains du monde réel parviennent à capturer des machines et à les rallier à leur cause grâce notamment à un programme de simulation spécial. Cependant l'expérience s'avère assez hasardeuse......

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Stark a envoyé son ami Jim Rhodes (Rhodey) pour déblayer des ruines d’un temple Mandarin pour le gouvernement chinois avant que celles-ci s’écroulent. Mais un groupe nommé ‘Les Dragons de Jade’ ne désire pas laisser les fouilles se terminer. Après une attaque des Dragons de Jade, Jim Rhodes est capturé, ce qui oblige enfin Tony Starck à se déplacer. À peine arrivé, que Starck se trouve pris dans une embuscade et est grièvement blessé au cœur! …...

Oliver, illustrateur à Los Angeles, collectionne les ex et les déceptions amoureuses. Quand son père, Hal, tire sa révérence après avoir fait son coming-out à 75 ans et rejoint avec entrain la communauté homosexuelle, Oliver se penche sur ses relations familiales et ses échecs sentimentaux. Et il hérite d'un chien philosophe et bavard. La dépression le guette, jusqu'au jour où il rencontre Anna......

Le Docteur Octopus, un brillant scientifique qui travaillait sur une nouvelle invention révolutionnaire dans son laboratoire, se retrouve à la suite d'un accident avec des bras mécaniques greffés sur le corps. Devenu le terrifiant Docteur Octopus, il cherche maintenant à se venger de ceux qui ont fait de lui un monstre et il n'y a qu'un homme qui puisse mettre un terme à son terrible plan de destruction: Spider-Man......

Richard, petit garçon du monde réel, arrive au Royaume des Songes. Sa présence provoque la destruction du tunnel qui relie les deux mondes. Mini Loco, le petit train bleu, va tout tenter pour ramener le jeune garçon chez lui. Mais il va devoir faire face à une terrible menace en affrontant le Train des Cauchemars......

Pour rien au monde Tarzan n'aurait voulu quitter la jungle où il a grandi. Pourtant, un événement tragique le conduit dans un univers qui n'est pas le sien : la ville New York où il doit non seulement venger le meurtre de sa mère adoptive par de cruels chasseurs, mais retrouver son ami de toujours, le chimpanzé Cheetah, prisonnier d'un redoutable homme d'affaires. Avec l'aide de la belle Jane Porter et de son père Archie, Tarzan déjoue les pièges que lui tendent des ennemis sans scrupules…...

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En 1943, la marine américaine expérimente à Philadelphie l'innovation du docteur James Longstreet, destinée à faire disparaître les bateaux alliés des radars ennemis. Alors qu'un test est effectué sur l'USS Eldridge un incident survient : deux des matelots, David et Jim, sont projetés en 1984....