Le film raconte l'histoire de Shun, un jeune duelliste amateur qui, par hasard, va un jour se retrouver en possession du Dragon Noir aux Yeux Rouges. La carte étant très rare, Seto Kaiba cherche à s'en emparer, mais Yugi se trouve, une fois encore, sur son chemin....

Aux quatre coins du monde, pendant leur sommeil, des enfants se font kidnapper. Ils sont hypnotisés par une étrange musique qui les conduit tout droit au siège de Queen Badiane, le château Massepain. Là, la méchante reine, aidée de ses quatre sbires Perle, Poupelin, Banane et Orangeat, endort à jamais les enfants, dont les rêves sucrés alimentent le gouffre des cauchemars. Cet étrange trou noir grandit de nuit en nuit, prêt à tout instant à avaler la Terre tout entière......

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Ce fut une matinée tout à fait normale pour Ami. À un détail prêt, Ami va avoir affaire à la chose qu'elle déteste le plus au monde : la lettre d'amour. En effet, elle en reçoit une dans son casier de si bon matin. En fait, Amy préfère étudier pour rentrer au lycée que d'avoir une histoire d'amour…...

Cet épisode spécial, réalisé à l'occasion des 20 ans de la série, reprend tout l'arc East Blue, jusqu'à ce que l'équipage arrive sur Grand Line. L'histoire débute en pleine ère de la piraterie, lorsque le jeune Luffy quitte son village natal pour devenir pirate. En chemin, il fait la connaissance de Zoro, Nami, Usopp et Sanji, qui deviendront ses premiers compagnons....